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解決済みの質問

タンパク質からDNA塩基配列を決める方法

例えば、HIVのエンベロープタンパク質のアミノ酸配列を指定する塩基配列がHIVRNAのどこにあるのか、またその配列は何か、というような問題はどう答えればいいのでしょうか?

RNA→cDNA→mRNA→タンパク質 という流れで、RNAから、タンパク質を明らかにできるのはわかるのですが、逆にタンパク質からその遺伝子のRNA/DNA配列を同定にはどうするのでしょうか?

決定法の名前だけでも助かります。気になったので、、

投稿日時 - 2016-11-07 12:32:12

QNo.9252699

困ってます

質問者が選んだベストアンサー

良くあることですが,あるタンパク質の保存されたアミノ酸配列に対してprimerを設定してサブファミリーを同定する様な場合,

例えばグリシンだとGGまでは一緒ですがどのコドンを使用するかでT C G Aと四種類可能性があります。Ala(アラニン)であれば,GCのつぎはこれも4通りあります。
コドン表を参考にしてください。

動物によってどのコドンを使用しやすいかの好みはあるものの,100%ではありませんので,グリシンーアラニンーグリシンのアミノ酸配列だと G-G-N-G-C-N-G-G-N (NハATGCいずれの可能性有り) という配列だと言うことまでは分かります。
このようなprimerを作製することで,アミノ酸配列が保存された領域をPCRで同定するという方法はあります。

投稿日時 - 2016-11-07 23:31:57

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